Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFMBT1Q9UHJ3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms