Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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