Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A4GALTQ9NPC4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms