Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms