Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX33Q8WV41 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms