Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms