Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPOCD1Q6ZMY3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms