Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF1AQ16665 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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