Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITSN1Q15811 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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