Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA9Q13797 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms