Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MKRN4PQ13434 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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MKRN4PQ13434 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MKRN4PQ13434 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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