Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CYP27A1Q02318 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CYP27A1Q02318 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms