Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms