Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms