Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOSBP53539 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FOSBP53539 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOSBP53539 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOSBP53539 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOSBP53539 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOSBP53539 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOSBP53539 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOSBP53539 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOSBP53539 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOSBP53539 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOSBP53539 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms