Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4AP27815 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4AP27815 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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