Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD247P20963 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD247P20963 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD247P20963 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD247P20963 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms