Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRHP20396 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRHP20396 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRHP20396 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRHP20396 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRHP20396 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRHP20396 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRHP20396 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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