Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACTN1P12814 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms