Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms