Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

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Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPHP1O15259 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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NPHP1O15259 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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NPHP1O15259 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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NPHP1O15259 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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NPHP1O15259 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHP1O15259 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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