Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CEP290O15078 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP290O15078 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP290O15078 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP290O15078 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CEP290O15078 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP290O15078 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP290O15078 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP290O15078 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEP290O15078 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CEP290O15078 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CEP290O15078 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CEP290O15078 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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CEP290O15078 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP290O15078 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEP290O15078 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CEP290O15078 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CEP290O15078 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CEP290O15078 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP290O15078 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP290O15078 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP290O15078 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP290O15078 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP290O15078 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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CEP290O15078 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CEP290O15078 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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