Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms