Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms