Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRGMA1A4Y4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms