Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms