Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms