Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC7Q96NW7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms