Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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