Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARMIL1Q5VZK9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms