Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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