Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTP4A2Q12974 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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