Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF2Q12947 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms