Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TROQ12816 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TROQ12816 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TROQ12816 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TROQ12816 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TROQ12816 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TROQ12816 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TROQ12816 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TROQ12816 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TROQ12816 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
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