Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms