Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTBP60709 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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