Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms