Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2AP24928 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms