Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atf2P16951 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms