Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EPCAMP16422 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms