Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFNB1P01574 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms