Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRODHO43272 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRODHO43272 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRODHO43272 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRODHO43272 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms