Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms