Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms