Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXD4L1Q9NU39 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms