Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MTMR12Q9C0I1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR12Q9C0I1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms