Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TREX2Q9BQ50 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms