Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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