Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPA33Q99795 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms