Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms